Od 9 lat pracuje w Klinice Choroby Wieńcowej i Niewydolności Serca w KKS im. Jana Pawła II. W 2015 roku uzyskał tytuł doktora nauk medycznych. W 2016 roku uzyskał specjalizację z kardiologii z wynikiem dobry plus. Od 2016 zajmuje stanowisko adiunkta w Zakładzie Dydaktyki Medycznej CMUJ. Doktor Mateusz Podolec zajmuje się chorobą niedokrwienną serca (ok. 1400 zabiegów inwazyjnych na naczyniach wieńcowych), nabytymi wadami zastawkowymi, niewydolnością mięśnia serca. Kwalifikuje chorych do zabiegów TAVI oraz MitraClip. Od początku pracy wykonuje badania echokardiograficzne (ok 2-3 tysięcy wykonanych badań) oraz badania USG tętnic (ok. 2 tysiące badań). Dodatkowo posiada uprawnienia i operatora w dziedzinie kardiologii inwazyjnej (wykonuje ok. 150 angioplastyk rocznie). Od 2017 r. jest członkiem zespołu TAVI.